Komite Investigasi Rusia mengatakan sekte itu sedang diperiksa karena menggunakan 'kekerasan psikologis' yang menyebabkan beberapa pengikut 'membahayakan kesehatan mereka'.
Torop dan dua pemimpin sekte lainnya Vadim Redkin dan Vladimir Vedernikov ditahan dalam serangan itu, kata sebuah pernyataan.
Mereka juga sedang diselidiki karena dicurigai 'menyebabkan luka tubuh yang menyedihkan bagi dua orang atau lebih'.
Rekaman menunjukkan pasukan khusus bertopeng dengan senapan mesin tempur di wilayah kelompok itu di distrik Kuraginsky yang terpencil di wilayah Krasnoyarsk di Siberia.
Petugas lain tampak berpakaian preman.
Komentar 'Umat' Sergei Torop
Penduduk lokal Alexander Staroverov berkata: "Ada 50 avtozaks (sel di atas roda), 50 bus, ambulans, dan pekerja medis."
Torop dan Redkin 'dimasukkan ke dalam helikopter dan dibawa pergi ke arah yang tidak diketahui', tambahnya.
Kelompok atau 'umat' Sergei Totop, yang dilarang merokok dan alkohol, telah berada di Siberia selama bertahun-tahun dan tidak jelas mengapa pihak berwenang Rusia sekarang bertindak dalam penggerebekan dini hari.
Dia mengklaim memiliki 5.000 pengikut, beberapa ratus di antaranya tinggal di gubuk kayu di kamp 'Sun City' terpencil di Petropavlovka, sekitar 2.600 mil di timur Moskow.