Komoditas laut Natuna terbagi dalam dua kategori, yaitu ikan pelagis dan ikan demersal.
Potensi ikan pelagis di Natuna mencapai 327.976 ton per tahun, dengan jumlah tangkapan yang dibolehkan 262.308,8 ton.
Dari jumlah tersebut baru dimanfaatkan sebesar 37 persen atau 99.037 ton. Ikan pelagis merupakan ikan yang hidup di permukaan air hingga kolam dengan kedalaman 200 meter.
Ikan yang masuk dalam kategori pelagis adalah ikan tuna, ikan pedang, marlin, cakalang, tenggiri, dan massih banyak lainnya.
Selain itu laut Natuna juga memiliki potensi ikan demersal hingga 159.700 per tahun. Namun yang dimanfaatkan baru mencapai 40.491 ton per 2014.
Ikan demersal adalah ikan yang hidupnya di dasar laut, baik untuk mencari makan atau berkembang biak.
Ikan demersial yaitu ikankerapu, tongkol krai, tenggiri, ikan ekor kuning, udang putih, kepiting, dan masih banyak lainnya.
Lokasi penangkapan kapal besar umumnya berada di luar lokasi 4 mill laut yangh berada di wilayah laut Natuna, Laut China Selatan.
Minyak dan gas bumi
Laut Natuna memiliki cadangan minyak bumi diperkirakan hingga 14.486.470 barel dan gas bumi mencapai 112.356.680 barel.