Sebab Turki menampung jutaan migran dan membuat kesepakatan dengan UE yang membatasi jumlah yang tiba di Yunani.
Pengumuman hotline menyusul pembicaraan antara Turki dan Yunani di markas NATO di Brussels.
"Saya menyambut baik pembentukan mekanisme de-konflik militer, yang dicapai melalui keterlibatan konstruktif Yunani dan Turki, keduanya menghargai sekutu NATO," kata Sekretaris Jenderal NATO Jens Stoltenberg.
"Mekanisme keamanan ini dapat membantu menciptakan ruang bagi upaya diplomatik untuk mengatasi perselisihan yang mendasarinya dan kami siap untuk mengembangkannya lebih lanjut."
Mekanisme semacam itu memungkinkan komunikasi langsung antara dua sisi.
Contohnya saat Rusia dan ASberperangselama Perang Dingin dan telah beroperasi sejak itu.
Pada bulan Agustus, dua kapal perang Turki dan Yunani bertabrakan di Mediterania Timur.
Sejak itu ketegangan agak mereda, dengan kapal penelitian Turki meninggalkan daerah itu bulan lalu dan kedua belah pihak mengatakan mereka siap untuk melanjutkan pembicaraan.
Akan tetapi muncul berita bahwapara pemimpin UE tiba di tempat lain di Brussel untuk pertemuan.