Karyoto berpengalaman dalam bidang reserse.
Tahun 2010, Karyoto betugas sebagai Penyidik Utama Tk II Dit III/Kor Dan WCC Bareskrim Polri, dan pada tahun 2011 sebagai Kasubdit III Dittipidkor Bareskrim Polri.
Selanjutnya, Kapolresta Barelang (2012), Dirreskrimum Polda DIY (2014), Analis Kebijakan Madya Bidang Pideksus Bareskrim Polri (2015), Direktur Analis Pemutus Jaringan Internasional BNN (2016), dan Analis Kebijakan Utama Bidang Pidkor Bareskrim Polri (2018).
Di periode yang sama, Karyoto pernah menjabat sebagai Wakapolda Sulawesi Utara (2018) dan Wakapolda DIY pada 2019.
Karyoto kemudian ditugaskan ke KPK dan menduduki jabatan sebagai Deputi Penindakan (2020).
Salah satu perkara besar yang ditangani Karyoto adalah kasus korupsi terkait izin ekspor benih lobster yang menjerat Mantan KKP Edhy Prabowo dan kasus korupsi bansos Covid-19 yang menjerat Menteri Sosial Juliari Batubara saat itu.
(*)