Portugal memulai gugatan terhadap Australia di Mahkamah Internasional karena perjanjian itu melanggar hak penentuan nasib sendiri Timor Leste.
Namun, tidak ada hasil dan kekerasan berlanjut, yang berpuncak pada pembantaian lebih dari 250 orang Timor oleh pasukan Indonesia di pemakaman Santa Cruz di Dili pada 12 November 1991.
Apa yang Terjadi setelah Timor Leste Merdeka
Setelah Timor Timur merdeka pada tahun 2002, Perjanjian Celah Timor tidak lagi berlaku.
Australia menandatangani serangkaian perjanjian dari 2002 hingga 2006 dengan negara yang baru merdeka.
Perjanjian 2002 menetapkan Wilayah Pengembangan Minyak Bersama (JDPA), dengan bagi hasil 90:10 untuk keuntungan Timor Lorosae.
Banyak hal berubah sangat menguntungkan Australia dengan perjanjian 2006.
Kedua negara sepakat bahwa pendapatan Greater Sunrise Unit Area (GSUA) akan dibagi 50:50, dan bahwa penetapan batas laut yang sebenarnya akan ditangguhkan selama lima puluh tahun lagi.
Pada titik ini, Australia sudah menarik dari ladang Bayu-Undan yang terletak di Laut Timor dan mengambil keuntungan darinya.
Ditemukan pada tahun 1995, ladang Bayu-Undan berada dalam Joint Petroleum Development Area (JPDA) dan dioperasikan oleh ConocoPhilips Australia, pemegang saham mayoritas, hingga 2018.
Perjanjian 2006 juga menjadi tidak valid ketika diketahui bahwa dinas intelijen rahasia Australia telah melakukan spionase.