Wawan pun kemudian memulai debut profesional di tanah "ngapak" dengan memperkuat Persebas Banyumas pada 2002.
Selama dua musim bermain untuk Laskar Bawor, permainan Wawan kemudian memikat Persikabo Bogor.
Ia pun bermain di kota hujan itu pada musim 2005 hingga 2006.
Setelah dari Persikabo Bogor, Wawan pindah ke Persikab Bandung pada musim kompetisi 2006-07.
Karier Wawan pada masa-masa awal lebih banyak berkutat di sepak bola kasta kedua atau ketiga.
Setelah dari Persekab Bandung, pada 2007 Wawan sempat menajajal seragam Pelita Jaya.
Peruntungan Wawan mulai berubah ketika dia memperkuat Persita Tangerang pada musim 2008-09.
Selain mencatatkan 21 penampilan, bersama Laskar Cisadane itulah nama Wawan mulai dikenal lebih luas.
Titik balik karier Wawan terjadi ketika bermain untuk Persisam Samarinda pada musim 2009-10.
Selama dua musim bermain untuk klub asal Kalimantan Timur itu, Wawan unjuk gigi sebagai kiper tangguh di pentas Liga Super Indonesia.
Sempat bergabung dengan Deltras Sidoarjo pada 2011-12, keputusan I Made Wirawan hengkang dari Persiba Balikpapan pada 2012 telah membukakan jalan kedua bagi Wawan.